Fundo
A asma é uma doença comum em crianças com uma origem genética complexa. Compreensão da base genética da susceptibilidade à asma permitirá previsão doença e estratificação de risco.
Objetivo
Buscou-se identificar genes de susceptibilidade de asma em crianças.
Métodos
Um caso-controle aninhado estudo de associação genética dos filhos de ascendência européia caucasiana de uma coorte de nascimentos foi conduzido. Polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs, n = 116.024) foram genotipados em poças de amostras de DNA de crianças da coorte com diagnóstico médico de asma (n = 112) e controles normais (n = 165). A região genômica contendo o ATPAF1 gene foi encontrado para ser significativamente associados à asma. SNPs adicionais dentro desta região foram genotipados em amostras individuais das crianças e mesmo em 8 populações de estudo independente de caucasianos, Africano americanos, hispânicos, ou outras ascendências. SNPs também foram genotipadas ou imputado em duas populações de controlo consórcios. ATPAF1 expressão foi medida em biópsias brônquicas de pacientes asmáticos e controles.
Resultados
Asma foi encontrado para ser associado com um conjunto de SNPs e haplótipos SNP contendo o ATPAF1 gene, com dois SNPs alcançar significância (ao nível do genoma P = 2.26 × 10 -5 a 2,2 × 10 -8 ). Gravidade da asma também foi encontrado para ser associado com SNPs e haplótipos SNP na população primária. SNP e / ou gene nível de associações foram confirmados no 4 não-hispânicos populações. Haplótipo associações também foram confirmados em populações não-hispânicos ( P = .045 -. 0009). ATPAF1 expressão do RNA total foi significativamente ( P <0,01) maior em biópsias brônquicas de pacientes asmáticos do que dos controles.
Conclusão
Variação genética na ATPAF1 gene predispõe filhos de diferentes ascendências à asma.
Palavras-chave: Asma , ATPAF1 , crianças , gene , genética , genoma-largo da associação , purinérgicos , respiratórias , polimorfismo de nucleotídeo único , SNP
Abreviaturas utilizadas: ATP , adenosina trifosfato , CAMP , Childhood Asthma Management Program , CARE , Pesquisa Asma Infância e da rede de Educação , GALA , Genética da asma em americanos Latino , GWAS , Genome-wide estudos de associação , IOW , Isle of Wight , LD , Linkage desequilíbrio , OR , odds ratio , RNA , ácido ribonucléico , SLEGEN , Consórcio Internacional para o Lúpus Eritematoso Sistêmico Genetics , SNP , polimorfismo de nucleotídeo único , WTCCC , Wellcome Trust Control Consortium Caso
Fonte:
http://www.jacionline.org/article/S0091-6749(11)00798-6/abstract
